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解析實時熒光定量PCR技術中幾個重要概念
實時熒光定量PCR技術中有幾個重要的概念,包括擴增曲線、基線、熒光閾值和域值循環數。
1、擴增曲線(amplification curve):
是在實時熒光定量PCR中監測到的熒光信號隨著循環數變化而繪制的一條曲線。在進行PCR反應過程中,通過檢測系統對PCR管內的樣品進行實時檢測,最后將熒光信號值通過成像技術顯現在計算機上。正常的擴增曲線包括四個階段:基線期、指數增長期、線性增長期、平臺期。
2、基線(baseline):
是背景曲線的一段,在擴增反應的最初數個循環里熒光信號變化不大,接近一條直線。
3、熒光閾值(threshold):
是在熒光擴增曲線指數增長期設定的一個熒光強度標準(即PCR擴增產物量的標準)。熒光閾值可以設定在PCR擴增的指數期。
4、閾值循環數:
表示每個PCR反應管內熒光信號達到設定的熒光閾值所經歷的循環數,研究表明,各模板的CT值與該模板的起始拷貝數的對數存在線性關系,即起始拷貝數越多,CT值越小;起始拷貝數越少,CT值越大。我們利用已知起始拷貝數的標準品可做出以起始拷貝數的對數為橫坐標,CT值為縱坐標的一條標準曲線。只要獲得未知模板的CT值,即從標準曲線上計算出該模板的起始拷貝數。
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